牙醫(yī)周汝川博士鑒于戰(zhàn)后臺(tái)灣的牙醫(yī)師人才奇缺，遂于1960年創(chuàng)設(shè)該校，初創(chuàng)之時(shí)只有牙科，名為中山牙科專科學(xué)校，簡(jiǎn)稱中山牙專。1962年5月設(shè)醫(yī)科為中山醫(yī)學(xué)專科學(xué)校，簡(jiǎn)稱中山醫(yī)專，其后再增設(shè)護(hù)理科與醫(yī)事技術(shù)科。牙科、醫(yī)科、護(hù)理科招收高中畢業(yè)生，牙科修業(yè)初為四年后延長(zhǎng)為五年，醫(yī)科修業(yè)先為四年后延長(zhǎng)為五年乃至六年，護(hù)理科修業(yè)為三年均屬三專學(xué)歷，醫(yī)技科招收初中畢業(yè)生修業(yè)五年，屬于五專學(xué)歷。

在1977年4月獲準(zhǔn)昇格為學(xué)院，改名為中山醫(yī)學(xué)院。2001年7月教育部審核通過(guò)，正式改制為中山醫(yī)學(xué)大學(xué)，同年8月附設(shè)醫(yī)院也奉準(zhǔn)改制更名為“中山醫(yī)學(xué)大學(xué)附設(shè)醫(yī)院”。

目前有醫(yī)學(xué)院、口腔醫(yī)學(xué)院、健康管理學(xué)院及醫(yī)學(xué)科技學(xué)院等四個(gè)學(xué)院，共有二十一個(gè)醫(yī)學(xué)相關(guān)科系、十八個(gè)研究所，其中七個(gè)科系有博士班。

中山醫(yī)大學(xué)生總數(shù)達(dá)7385人，于醫(yī)學(xué)大學(xué)中排名第二，僅次于中國(guó)醫(yī)大7410人（高醫(yī)大6896人，北醫(yī)大5840人，陽(yáng)明大學(xué)4084人，慈濟(jì)大學(xué)3389人）