鹽城市婦幼保健院創建于1986年，2010年被評審為三級甲等婦幼保健院，系江蘇省首批“愛嬰醫院”。醫院是揚州大學醫學院附屬醫院﹑江蘇醫藥職業學院附屬醫院，蘇州大學醫學部、安徼醫科大學教學醫院。

醫院是江蘇省人民醫院戰略協作醫院，復旦大學附屬兒科醫院定點合作單位,上海市紅房子婦產科醫院技術協作單位，醫院和國內許多著名醫院建立了協作關系，并定期邀請國內外知名專家來院講學﹑坐診、臨床示教等。

醫院堅持“病人至上，團隊合作”的核心價值觀，緊緊圍繞“科技興院﹑人才強院、管理立院”的科學發展思路，進一步加快醫院發展，深化醫院內涵建設，全面提升醫院整體實力，整體工作取得了長足發展，已成為一所承擔鹽城及周邊地區婦女兒童保健與醫療任務的三級甲等婦幼保健院。未來將進一步立足鹽城，服務周邊，輻射全省，全力打造高水平的區域性婦女兒童醫療保健中心。

醫院于2019年7月整體搬遷至鹽城市世紀大道31號，醫院總占地面積166畝，建筑面積12.66萬平方米，固定資產10多億元。有高級職稱技術服務人員150余名，博﹑碩士80余名，各類省市級人才30余名。兒科是省級臨床重點專科，新生兒科是省婦幼保健重點學科。兒科、婦科、產科、新生兒科、生育技術科、麻醉科、超聲科、兒保科、兒外科、兒童神經內科分別是市級醫學重點學科、專科。

醫院堅持內函與外延并重，著力打造跨越式發展的學科、科研、管理、服務、信息化﹑保障等系列體系。形成了以八個中心《省乳腺疾病診療中心鹽城分中心、新生兒疾病篩查中心、新生兒聽力篩查中心、新生兒視力篩查中心、生殖醫學中心、產前診斷中心、新生兒急救中心、兒童心臟病救治中心）為品牌、六個學科《婦科、產科、兒內科、兒外科、新生兒科、兒童保健與康復科）為支撐、三個基地《國家級住院醫師規范化培訓基地協同醫院﹑市兒科護理專科護士培訓基地、市產科護理專科護士培訓基地）為依托、三個網絡《市危重新生兒及嬰兒轉運網絡、市婦幼健康服務聯合體網絡、市婦幼衛生信息平臺網絡）為優勢的科學體系。